Kada neočekivana mećava zatrpa grad, vlasti odluče zatvoriti ceste i škole. Petnaestogodišnji Hal (Mark Webber) odluči iskoristiti priliku i zavesti Claire, školsku kolegicu, u koju je već neko vrijeme ludo zaljubljen. No problem je u tome što najpopularnija djevojka u razredu već ima...
Prošlo je nekoliko mjeseci otkako su mutanti zaustavili Williama Strykera, ali su to platili gubitkom Jean Gray, s čime se Scott nikako ne može pomiriti. Odlazi na mjesto na kojem ju je izgubio i ona se pojavi pred njim. Sukobi ljudi i mutanata, koji dosežu kritičnu točku, mogli bi uskoro...
Nakon međusobne borbe u prvom filmu, mutantski neprijatelji profesor Xavier i Magneto moraju se udružiti da nađu mutanta ubojicu koji je pokušao smaknuti predsjednika dok Mutantsku akademiju napadaju oružane snage.